Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms