Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms