Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms