Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms