Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFM1P61960 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFM1P61960 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UFM1P61960 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms