Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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