Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms