Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms