Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms