Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV1P50549 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms