Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms