Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms