Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA2P47869 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA2P47869 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA2P47869 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms