Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD52P43351 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD52P43351 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD52P43351 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD52P43351 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD52P43351 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD52P43351 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD52P43351 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD52P43351 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD52P43351 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD52P43351 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD52P43351 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD52P43351 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD52P43351 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD52P43351 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms