Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms