Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms