Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms