Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRB3P28472 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms