Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms