Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms