Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms