Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRGP23470 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRGP23470 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRGP23470 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRGP23470 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRGP23470 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRGP23470 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRGP23470 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTPRGP23470 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRGP23470 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRGP23470 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRGP23470 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRGP23470 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRGP23470 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRGP23470 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRGP23470 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRGP23470 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRGP23470 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRGP23470 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRGP23470 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRGP23470 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRGP23470 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
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