Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms