Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2P22307 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2P22307 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2P22307 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2P22307 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2P22307 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2P22307 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2P22307 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2P22307 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2P22307 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2P22307 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2P22307 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2P22307 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms