Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PTPRAP18433 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRAP18433 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRAP18433 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRAP18433 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRAP18433 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRAP18433 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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