Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XBP1P17861 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XBP1P17861 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XBP1P17861 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms