Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAV1P15498 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAV1P15498 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAV1P15498 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAV1P15498 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAV1P15498 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAV1P15498 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAV1P15498 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAV1P15498 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAV1P15498 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAV1P15498 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAV1P15498 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAV1P15498 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAV1P15498 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAV1P15498 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAV1P15498 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAV1P15498 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAV1P15498 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAV1P15498 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAV1P15498 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms