Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms