Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNT1P13805 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNT1P13805 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms