Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms