Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms