Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRFP10586 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRFP10586 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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