Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L5P0DN76 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms