Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2P0DI81 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms