Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms