Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTMAP06454 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTMAP06454 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTMAP06454 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTMAP06454 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTMAP06454 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTMAP06454 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTMAP06454 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTMAP06454 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTMAP06454 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTMAP06454 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTMAP06454 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTMAP06454 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms