Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms