Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms