Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX4O95219 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX4O95219 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX4O95219 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX4O95219 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX4O95219 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX4O95219 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms