Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F6O75461 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F6O75461 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F6O75461 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F6O75461 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F6O75461 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F6O75461 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms