Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms