Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DENRO43583 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
DENRO43583 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DENRO43583 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DENRO43583 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms