Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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