Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM6BO15054 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms