Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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