Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms