Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms