Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DGG1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DGG1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms