Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms