Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms